Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms