Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACAD11Q709F0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms