Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms