Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC23Q6ZST2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms