Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6Q795 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q6Q795 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms