Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms