Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC62Q6P9F0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms