Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EFCAB12Q6NXP0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms