Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRC8EQ6NSJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms