Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACHD1Q5VU97 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACHD1Q5VU97 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms