Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms