Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TMEM78Q5T7P6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TMEM78Q5T7P6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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