Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms