Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN4Q5BKX8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms