Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6CQ53S08 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms