Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ANKRD39Q53RE8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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ANKRD39Q53RE8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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ANKRD39Q53RE8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39Q53RE8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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