Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms