Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP13-3Q3SY46 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms