Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKIDA1Q1XH10 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SKIDA1Q1XH10 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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