Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC142Q17RM4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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