Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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RTL8BQ17RB0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RTL8BQ17RB0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RTL8BQ17RB0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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