Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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