Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EXT1Q16394 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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EXT1Q16394 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EXT1Q16394 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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