Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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