Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
USF2Q15853 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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