Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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VAMP3Q15836 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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