Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIP13Q15645 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms