Protein–RNA interactions for Protein: Q15633

TARBP2, RISC-loading complex subunit TARBP2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2Q15633 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TARBP2Q15633 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TARBP2Q15633 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms