Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SKIV2LQ15477 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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