Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RFTN1Q14699 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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