Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF235Q14590 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF235Q14590 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms