Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP1Q13835 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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