Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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ITGA9Q13797 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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