Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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NCOA4Q13772 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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