Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX3Q13761 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX3Q13761 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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