Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1SQ13698 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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