Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL4BQ13620 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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