Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEUROD1Q13562 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEUROD1Q13562 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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