Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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