Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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