Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MSLNQ13421 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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