Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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