Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2BQ13224 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2BQ13224 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
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