Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKAA1Q13131 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PRKAA1Q13131 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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