Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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