Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms