Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST3GAL1Q11201 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms