Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms