Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms