Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD47Q08722 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD47Q08722 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD47Q08722 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD47Q08722 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms